Ser najlepiej kupować w małych ilościach i przechowywać w warunkach, w jakich dojrzewał. Sery twarde, półtwarde i półmiękkie przechowuje się w temperaturze od 1o do 5oC

Jeśli ser przechowujemy w lodówce, należy go luźno owinąć w papier pergaminowy tak, aby zapewnić obieg powietrza. Należy unikać zbyt ścisłego owijania w folię. Przed podaniem na stół, ser należy wyjąć godzinę wcześniej z lodówki, aby mógł w pełni rozwinąć swój aromat.

Sery pleśniowe niebieskie należy dobrze owinąć folią, pamiętając, że pleśń rozprzestrzenia się nie tylko w serze ale także poza nim i może wpłynąć na inne produkty spożywcze przechowywane w sąsiedztwie.

Serów nie należy przechowywać razem z innymi produktami spożywczymi o silnym aromacie, ponieważ mogą się wzajemnie przenikać.